R语言与生信绘图

R语言绘图代码整理，提供示例数据，代码可直接运行。

基础可视化

韦恩图 venn包
韦恩图 ggvenn包
成比例韦恩图 eulerr包
upset图
箱线图
小提琴图
核密度图
山峦图
簇状柱形图
堆积柱形图
百分比柱形图
雷达图 ggradar包
双向柱形图
饼图 graphics包
甜甜圈图 graphics包
层次树形图 voronoiTreemap包
矩形树状图 treemap包
矩形树状图 treemapify包
棒棒糖图 ggpubr包
累积曲线
频率分布直方图
相互作用网络图(普通) ggraph包
相互作用网络图(线形) ggraph包
相互作用网络图(圆形) ggraph包
相互作用网络(html) networkD3包
散点密度图 ggpointdensity包
桑基图(html) networkD3包
桑基图 ggalluvial包
弦图 circlize包
不等宽柱形图
马赛克图 ggmosaic包
散点图+边缘分布图 ggExtra包
抖动散点图
蜂群图 ggbeeswarm包
词云图 wordcloud2包
花瓣韦恩图
带误差线的柱形图
圆形分组条形图

组学数据可视化

热图 pheatmap包
热图 ggplot2包
火山图
渐变火山图
多组差异火山图
ROC pROC包
PCA ggbiplot包
三维PCA scatterplot3d包
三维PCA plot3D包
交互三维PCA plotly包
相关性热图 pheatmap包
相关性矩阵 corrgram包
相关性矩阵 GGally包
相关性图 corrplot包
相关性图 ggcorrplot2包
相关性散点图
富集气泡图
趋势分析 Mfuzz包
趋势分析+热图合并图 Mfuzz+ggplot2包
动态变化范围图
序列标识图 ggseqlogo包
富集弦图 GOplot包
热图(html) d3heatmap包
KM生存曲线 survival+survminer包
圆形热图 circlize包
富集圈图 circlize包
桑基气泡图 ggalluvial包
时间依赖ROC timeROC包
带文字信息的热图
变异系数小提琴图

其他

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