3 装包方式总结
3.1 普通安装(从CRAN安装)
install.packages("包名")3.2 从Bioconductor安装（主要是一些生物学包）
# 先安装BiocManager包
install.packages("BiocManager")
# 再调用BiocManager包里的install函数安装
BiocManager::install("包名")3.3 从GitHub上安装
3.3.1 方式一： devtools
# 先安装devtools包
install.packages("devtools")
# 再调用devtools包里的install_github函数安装
devtools::install_github("github用户名/包名")3.3.2 方式二： remotes
# 先安装remotes包
install.packages("remotes")
# 再调用remotes包里的install_github函数安装
remotes::install_gitlab("github用户名/包名")3.4 下载到本地安装
3.4.1 CRAN
从https://cran.r-project.org/web/packages/available_packages_by_name.html中找到并下载R包到本地
install.packages(“路径+文件名称”)
install.packages("C://Users/82414/Downloads/ggplot2_3.3.5.tar.gz")注意：还需要按照CRAN上的提示安装此包的依赖包
3.4.2 Bioconductor
从http://bioconductor.org/packages/release/BiocViews.html#___Software中找到并下载R包到本地
上述方法
3.4.3 GitHub
从https://github.com/上找到并下载
解压并在R中打开此路径（setwd(“路径名”)）
安装
devtools::install_local()3.5 conda安装
如果使用了conda环境，可以用conda的功能安装R包，还会自动的安装所需要的lib环境，相当省心。
conda install r-包名3.6 常见问题总结
3.6.1 package ‘name’ is not available for this version of R
Warning in install.packages : package ‘Mfuzz’ is not available for this version of R
可能是包的名字写错了
通常情况下，一般是需要用到本文中第2或3种方法安装
从CRAN上检查此包需要的R版本，如果大于您的R版本，需要升级R
3.6.2 依赖包没有装上
- 去安装报错的依赖包，再去安装想要的那个包
3.6.3 need R > 4.1.2，but your R is 3.6.3
需要升级R
当然也可以强制安装
3.6.4 缺少rjava
受到R语言实战那本书的影响，xlsx包需要rjava环境，强烈建议弃用xlsx包，换用readxl包
3.7 附录
- CRAN有哪些包：
- Bioconductor有哪些包：
Bioconductor - BiocViewsbioconductor.org/packages/release/BiocViews.html#___Software
- anaconda查包：